För att skapa största samhällsnytta måste infrastrukturplanering ta ett helhetsgrepp. Alla pågående processer som nationella infrastrukturplaneringen, storstadsåtgärder och planering av höghastighetsjärnväg inom Sverigeförhandlingen måste kopplas samman. Trafikverket har därför fått i uppdrag att titta på transportsystemet för sträckorna där höghastighetsjärnvägen ska byggas, Jönköping-Malmö och Linköping-Borås, som ett underlag till den nationella infrastrukturplanen 2018.